291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2470 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2470  gluconate transporter  100 
 
 
438 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1028  gluconate transporter  62.91 
 
 
434 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238544  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7002  gluconate transporter  53.15 
 
 
445 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  46.35 
 
 
438 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  45.43 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  44.29 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  46.35 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  46.58 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  46.12 
 
 
438 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  45.89 
 
 
438 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  45.89 
 
 
438 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  45.89 
 
 
438 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  45.89 
 
 
438 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3386  gluconate transporter  48.86 
 
 
438 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  45.89 
 
 
438 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  45.54 
 
 
439 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  45.66 
 
 
438 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  48.15 
 
 
437 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  45.54 
 
 
439 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  45.54 
 
 
439 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  45.54 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  44.52 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  45.54 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  45.66 
 
 
463 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  45.66 
 
 
463 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  45.66 
 
 
439 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  45.43 
 
 
439 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  45.66 
 
 
439 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  45.66 
 
 
438 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2768  gluconate transporter  45.27 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  44.26 
 
 
439 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  42.83 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1403  high-affinity gluconate transporter  46.9 
 
 
437 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.633115  normal  0.430036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  40.75 
 
 
452 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  39.96 
 
 
452 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  39.96 
 
 
452 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0923  H+/gluconate symporter related permease  42.01 
 
 
444 aa  343  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.59595  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1420  H+/gluconate symporter or related permease  39.52 
 
 
499 aa  342  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  40.18 
 
 
448 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  40.36 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.36 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  40.72 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  41.26 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.36 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.36 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.36 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  40.36 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  40.36 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  39.69 
 
 
453 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  39.69 
 
 
453 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  39.69 
 
 
453 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  40.4 
 
 
453 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  40.36 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  40.36 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3704  gluconate transporter  40.93 
 
 
449 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  39.21 
 
 
449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  38.98 
 
 
450 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  41.63 
 
 
450 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  41.63 
 
 
450 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  41.63 
 
 
450 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  41.29 
 
 
450 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  38.75 
 
 
449 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  39.58 
 
 
453 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  39 
 
 
441 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  39.23 
 
 
441 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  38.78 
 
 
441 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  40.5 
 
 
450 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  38.78 
 
 
441 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  38.99 
 
 
453 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  38.78 
 
 
441 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  38.55 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  38.57 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  38.55 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  38.55 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  39.49 
 
 
453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  38.98 
 
 
449 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  39.53 
 
 
449 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  39.77 
 
 
450 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  37.88 
 
 
449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  38.93 
 
 
449 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  39.01 
 
 
465 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  37.82 
 
 
449 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  40.99 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  41.4 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  40.97 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  39.59 
 
 
450 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4193  gluconate transporter  39.77 
 
 
450 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>