16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0517 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  100 
 
 
167 aa  345  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  43.83 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  39.75 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  39.75 
 
 
170 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  38.27 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  43.31 
 
 
170 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  43.45 
 
 
252 aa  105  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  42.65 
 
 
235 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  36.89 
 
 
238 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  33.33 
 
 
201 aa  73.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  29.92 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  34.68 
 
 
242 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  30.7 
 
 
118 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  30.7 
 
 
118 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  26.55 
 
 
211 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  31.09 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>