184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0062 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2508  potassium-transporting ATPase subunit A  67.71 
 
 
572 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647115  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1151  potassium-transporting ATPase subunit A  56.25 
 
 
569 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.954025  hitchhiker  0.000269156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0375  potassium-transporting ATPase subunit A  62.98 
 
 
562 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.633145  normal  0.0212602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3616  potassium-transporting ATPase subunit A  66.96 
 
 
570 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0764098  hitchhiker  0.000193876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1982  potassium-transporting ATPase subunit A  59.79 
 
 
578 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00444877  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0062  potassium-transporting ATPase, A subunit  100 
 
 
573 aa  1147    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1975  potassium-transporting ATPase subunit A  64.19 
 
 
573 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3490  hypothetical protein  46.05 
 
 
569 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1014  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.07 
 
 
560 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.778785  normal  0.749115 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3784  osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  43.99 
 
 
553 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0475782  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3082  potassium-transporting ATPase subunit A  43.46 
 
 
574 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0624  potassium-transporting ATPase subunit A  42.21 
 
 
555 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0265088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0251  potassium-transporting ATPase, A subunit  45.65 
 
 
562 aa  428  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0703  potassium-transporting ATPase subunit A  40.91 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000479775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0739  potassium-transporting ATPase subunit A  40.91 
 
 
555 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4534  potassium-transporting ATPase subunit A  40.91 
 
 
555 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323384  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0654  potassium-transporting ATPase subunit A  40.91 
 
 
555 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000280629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  41.32 
 
 
590 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0647  potassium-transporting ATPase subunit A  40.73 
 
 
555 aa  422  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000038311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0646  potassium-transporting ATPase subunit A  40.73 
 
 
555 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000509464  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2850  potassium-transporting ATPase subunit A  43.77 
 
 
568 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0797  potassium-transporting ATPase subunit A  40.91 
 
 
555 aa  422  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.232104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  42.78 
 
 
579 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0815  potassium-transporting ATPase subunit A  40.73 
 
 
555 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03991e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0809  potassium-transporting ATPase subunit A  40.56 
 
 
555 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000041041  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  42.2 
 
 
582 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0894  potassium-transporting ATPase subunit A  40.56 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000369924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1956  potassium-transporting ATPase subunit A  41.22 
 
 
559 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1929  potassium-transporting ATPase subunit A  41.22 
 
 
559 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5925  potassium-transporting ATPase subunit A  42.36 
 
 
568 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  41.19 
 
 
590 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1195  potassium-transporting ATPase subunit A  40 
 
 
561 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  42.91 
 
 
578 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  40.85 
 
 
590 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  42.4 
 
 
595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  41.61 
 
 
567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  41.36 
 
 
567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  41.58 
 
 
571 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  41.23 
 
 
569 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  40.94 
 
 
567 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2383  potassium-transporting ATPase subunit A  41.65 
 
 
567 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959423  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  40.14 
 
 
567 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  41.16 
 
 
574 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  41.43 
 
 
571 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1743  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.61 
 
 
556 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0699  potassium-transporting ATPase, A subunit, degenerate  38.23 
 
 
563 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0291  potassium-transporting ATPase subunit A  40.44 
 
 
569 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.147023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  42.47 
 
 
811 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  40.93 
 
 
564 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3849  potassium-transporting ATPase subunit A  40.07 
 
 
579 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554495  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  40.7 
 
 
571 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  41.34 
 
 
564 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  40.65 
 
 
592 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0207  potassium-transporting ATPase subunit A  39.83 
 
 
581 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  41.4 
 
 
571 aa  389  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  39.69 
 
 
567 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  41.58 
 
 
571 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3973  potassium-transporting ATPase subunit A  38.93 
 
 
561 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.619607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1889  potassium-transporting ATPase subunit A  39.59 
 
 
569 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  40.75 
 
 
567 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  38.59 
 
 
610 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  39.96 
 
 
561 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  41.22 
 
 
559 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  41.25 
 
 
564 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  40.22 
 
 
569 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  41.2 
 
 
575 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  38.85 
 
 
605 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0895  potassium-transporting ATPase subunit A  41.35 
 
 
578 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  41.07 
 
 
564 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  40.42 
 
 
569 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  38.71 
 
 
596 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2114  potassium-transporting ATPase subunit A  40.07 
 
 
558 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  39.05 
 
 
571 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  39.89 
 
 
567 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2152  potassium-transporting ATPase subunit A  40.07 
 
 
558 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3712  potassium-transporting ATPase subunit A  38.3 
 
 
575 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.147727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  39.9 
 
 
594 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  39.93 
 
 
586 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  43.39 
 
 
572 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2232  K+-transporting ATPase, A subunit  41.61 
 
 
583 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.110931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1885  potassium-transporting ATPase, A subunit  41.61 
 
 
583 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.345668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  39.97 
 
 
567 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  39.37 
 
 
567 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  39.59 
 
 
592 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0059  potassium-transporting ATPase subunit A  39.33 
 
 
558 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2927  potassium-transporting ATPase subunit A  41.55 
 
 
561 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0061  potassium-transporting ATPase subunit A  39.33 
 
 
558 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  40.36 
 
 
557 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04387  potassium-transporting ATPase subunit A  37.46 
 
 
597 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  40.36 
 
 
557 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  40.36 
 
 
557 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2487  potassium-transporting ATPase subunit A  39.33 
 
 
558 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  41.43 
 
 
559 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  40.36 
 
 
557 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  40.36 
 
 
557 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  40.36 
 
 
557 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  41.43 
 
 
559 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  41.43 
 
 
559 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0443  potassium-transporting ATPase, A subunit  39.93 
 
 
584 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  40.36 
 
 
557 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>