14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08150  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35685  normal  0.0802632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3181  hypothetical protein  67.8 
 
 
169 aa  167  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1919  hypothetical protein  65.85 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.819187  hitchhiker  0.00942539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2645  hypothetical protein  60.74 
 
 
132 aa  160  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2044  hypothetical protein  64.1 
 
 
128 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0575626  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0047  hypothetical protein  61.79 
 
 
124 aa  153  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0058  hypothetical protein  63.56 
 
 
134 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1819  hypothetical protein  60.48 
 
 
128 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4303  hypothetical protein  63.25 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1800  hypothetical protein  65.45 
 
 
120 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.941556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1819  hypothetical protein  65.45 
 
 
120 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1866  hypothetical protein  65.45 
 
 
120 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3128  hypothetical protein  63.25 
 
 
123 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.321514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1898  hypothetical protein  64.08 
 
 
129 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.94134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>