More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00800  ABC-type sugar transport system, permease component  100 
 
 
272 aa  528  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0202358  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
273 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
273 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 
273 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  38.49 
 
 
273 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  38.49 
 
 
273 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
273 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  38.49 
 
 
273 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  38.49 
 
 
273 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  38.49 
 
 
273 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 
273 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
291 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
303 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
304 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
297 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
296 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
270 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
284 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1458  ABC-type sugar transport system, permease component  37.5 
 
 
276 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
722 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  36.11 
 
 
315 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
299 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
286 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
272 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
268 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  38.24 
 
 
272 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  37.73 
 
 
701 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  38.31 
 
 
273 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
279 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
270 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
304 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
295 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 
701 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
279 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
277 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.390959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
276 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
271 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
279 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
743 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
307 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
301 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.1 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
284 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.42 
 
 
295 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
273 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
198 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
273 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0449998  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
291 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378357  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
291 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  33.33 
 
 
277 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
282 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
274 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.56 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
277 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
271 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
295 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
275 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
272 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
275 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  31.08 
 
 
269 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
301 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
285 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  30.4 
 
 
308 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
282 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
296 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 
277 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
268 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.620459  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
271 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
285 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
277 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.19 
 
 
279 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
272 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
273 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  32.68 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.48 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
324 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.34 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
285 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.92 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
321 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0784866  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
295 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
282 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  30.84 
 
 
285 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
275 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.96 
 
 
278 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
282 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>