More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2757 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2757  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
208 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.530786  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2857  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  96.63 
 
 
208 aa  420  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2689  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  97.12 
 
 
208 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.490642  normal  0.0512054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  83.57 
 
 
208 aa  360  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1426  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  70.87 
 
 
208 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.768484  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1403  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  70.87 
 
 
208 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1387  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71.5 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  68.6 
 
 
208 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2951  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  69.42 
 
 
208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.747988  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0702  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  57.35 
 
 
217 aa  238  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1216  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  62.57 
 
 
230 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2723  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.25 
 
 
203 aa  237  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.59 
 
 
203 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal  0.0120347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2637  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.29 
 
 
223 aa  224  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.59 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001438  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.43 
 
 
204 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.301342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1190  putative fumarylacetoacetate hydrolase  51.94 
 
 
204 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.43938  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06282  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  52.38 
 
 
204 aa  207  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0233  hypothetical protein  49.03 
 
 
204 aa  206  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1093  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.26 
 
 
202 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1402  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.35 
 
 
204 aa  197  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0057  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.51 
 
 
204 aa  191  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.43 
 
 
203 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.47 
 
 
225 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.03 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.66 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  42.64 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000122928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1996  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.46 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.18 
 
 
212 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.44 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  41.67 
 
 
218 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  39.46 
 
 
204 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  35.9 
 
 
222 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.67 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  41.21 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.7 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.88 
 
 
218 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000218618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40 
 
 
238 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  41.3 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8085999999999997e-26 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.99 
 
 
203 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  36.46 
 
 
219 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000473957  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  37.24 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  37.24 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  37.24 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2106  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.7 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  34.95 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  37.3 
 
 
219 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  37.3 
 
 
219 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  37.3 
 
 
219 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  37.3 
 
 
219 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  37.3 
 
 
219 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  36.04 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000267242  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  37.62 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  36.46 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.46 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000638137  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000019251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.36 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  36.67 
 
 
221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04150  hypothetical protein  36.67 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  35.91 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0354  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.62 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  33.85 
 
 
218 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  37.16 
 
 
218 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000304661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  37.16 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.48 
 
 
221 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  35.57 
 
 
218 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.48 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1039  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.55 
 
 
239 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  35.29 
 
 
219 aa  111  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.48 
 
 
221 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01210  mitochondrion protein, putative  36.79 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.490082  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  36.9 
 
 
231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3169  FAA-hydrolase-family protein  34.57 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3907  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.57 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01832  fumarylacetoacetate hydrolase  34.76 
 
 
237 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.856311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.91 
 
 
205 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.5 
 
 
232 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4146  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.5 
 
 
232 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160093  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1888  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.31 
 
 
232 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3617  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.99 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.224068  hitchhiker  0.00148113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  35.56 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3373  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.17 
 
 
234 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112296  normal  0.346453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0072  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.76 
 
 
225 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.620736  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4441  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.18 
 
 
232 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1692  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.9 
 
 
228 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.89 
 
 
221 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1291  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.96 
 
 
234 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0332  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  32.49 
 
 
233 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  33.51 
 
 
219 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1014  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  28.31 
 
 
249 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0403073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2909  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  34.52 
 
 
230 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.332948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.43 
 
 
232 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>