18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3368 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3538  hypothetical protein  98.39 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0585  hypothetical protein  97.18 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0666  hypothetical protein  69.72 
 
 		 242 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3690  hypothetical protein  69.72 
 
 		 242 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0687  hypothetical protein  68.92 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0697  hypothetical protein  68.53 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766.1  hypothetical protein  88.36 
 
 		 189 aa  360  9e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.591424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1143  hypothetical protein  42.07 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000972481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1348  hypothetical protein  41.18 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00722512  decreased coverage  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1156  hypothetical protein  45.91 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3410  hypothetical protein  28.96 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2544  hypothetical protein  27.8 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3934  hypothetical protein  27.85 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3228  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1207  hypothetical protein  25.1 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33810  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>