54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3137 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  95.97 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  95.16 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  95.16 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  95.16 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  95.16 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  81.45 
 
 		 124 aa  216  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  79.84 
 
 		 124 aa  213  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  80.65 
 
 		 124 aa  213  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  81.45 
 
 		 124 aa  209  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  77.42 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  62.81 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  55.37 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  56.1 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  56.1 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  57.85 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  56.1 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  53.28 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  56.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  55.28 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  53.23 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  55.74 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  54.17 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  50 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  54.4 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  52.42 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  52.29 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  53.6 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  51.38 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  49.6 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  48 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  48.18 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  47.27 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  52.29 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  34.51 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  40.74 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  41.23 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  39.81 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  37.39 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  31.53 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  54.1 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  43.68 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  51.56 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  40.43 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  42.86 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  36.14 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  40 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>