More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2788 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 100 aa  202  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  96 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  89 
 
 		 99 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1407  mercuric transport periplasmic protein MerP, putative  86.27 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  70.97 
 
 		 94 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  70.97 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  70.97 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  69.89 
 
 		 94 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  37.8 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  36.05 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 1182 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 836 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 837 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1013 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 1040 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  39.51 
 
 		 1063 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  39.51 
 
 		 1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 		 1063 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 		 760 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 		 760 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1021 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 1021 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 739 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 937 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 946 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 849 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 826 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  49.12 
 
 		 837 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 826 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  44.78 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 737 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 798 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 802 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 802 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 798 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 835 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 737 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  35.06 
 
 		 745 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 759 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 737 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 811 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 		 740 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 811 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 838 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 789 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 884 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 766 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 		 841 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 		 816 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 797 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  44.26 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 726 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 971 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 1071 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 765 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 		 758 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 833 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  44.26 
 
 		 817 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 737 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.76 
 
 		 819 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 827 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 779 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.88 
 
 		 794 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 905 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 790 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2126  Heavy metal transport/detoxification protein  38.82 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 819 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 754 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 		 785 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  36.49 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 757 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  41.18 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 798 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  36.26 
 
 		 841 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 737 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 839 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 835 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 909 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 761 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 770 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  42.65 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  42.65 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0610  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 719 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.424082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 867 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 813 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 720 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  38.57 
 
 		 792 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 810 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40 
 
 		 833 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  45 
 
 		 826 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 827 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 829 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 942 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 730 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  34.92 
 
 		 552 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>