99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2280 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  263  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2470  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  261  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2352  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  261  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363648  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1977  hypothetical protein  98.52 
 
 		 135 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2330  hypothetical protein  94.81 
 
 		 135 aa  253  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1744  hypothetical protein  91.85 
 
 		 135 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.810312  hitchhiker  0.00220396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2716  hypothetical protein  91.85 
 
 		 135 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2641  hypothetical protein  91.11 
 
 		 135 aa  246  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1940  hypothetical protein  85.93 
 
 		 135 aa  239  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2681  hypothetical protein  83.7 
 
 		 135 aa  234  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.95193  normal  0.733231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2147  hypothetical protein  85.07 
 
 		 135 aa  233  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1881  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2148  hypothetical protein  84.44 
 
 		 135 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.508072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2322  hypothetical protein  82.09 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1575  hypothetical protein  83.7 
 
 		 135 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00720647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2602  hypothetical protein  91.96 
 
 		 112 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5323  hypothetical protein  64.12 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0191  hypothetical protein  63.85 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1504  hypothetical protein  62.12 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.815589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1392  hypothetical protein  60.47 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.526699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05283  hypothetical protein  58.78 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000585  hypothetical protein  58.02 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.87989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1374  hypothetical protein  59.54 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1838  protein of unknown function DUF307  61.24 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.554714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0842  hypothetical protein  52.27 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4633  hypothetical protein  53.79 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.339978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7688  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0761  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10887  hypothetical protein  47.29 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.51401e-20  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4563  hypothetical protein  46.51 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4859  hypothetical protein  46.51 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364473  normal  0.0937936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4476  hypothetical protein  46.51 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.503682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0514  protein of unknown function DUF307  45.11 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00567512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4652  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3487  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0376  hypothetical protein  43.41 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4171  protein of unknown function DUF307  44.96 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.974051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0476  protein of unknown function DUF307  41.98 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3373  hypothetical protein  47.73 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1180  protein of unknown function DUF307  41.86 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00716366  normal  0.222129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3753  hypothetical protein  40.46 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5046  hypothetical protein  42.64 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0764  protein of unknown function DUF307  43.41 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4052  protein of unknown function DUF307  42.97 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8707  protein of unknown function DUF307  42.75 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184827  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6693  protein of unknown function DUF307  41.09 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2377  protein of unknown function DUF307  39.53 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1758  hypothetical protein  39.55 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0330869  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10870  predicted membrane protein  40.46 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6422  hypothetical protein  37.98 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0457  hypothetical protein  46.09 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000974641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3318  protein of unknown function DUF307  43.08 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1882  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1698  protein of unknown function DUF307  37.4 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.888972  hitchhiker  0.00956065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2545  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1115  hypothetical protein  39.85 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.00000000396693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1183  hypothetical protein  39.85 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1137  hypothetical protein  39.85 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.460412  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1032  hypothetical protein  39.85 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1149  hypothetical protein  39.85 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34090  predicted membrane protein  38.93 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2693  hypothetical protein  37.12 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2626  hypothetical protein  38.17 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.421081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2537  hypothetical protein  38.17 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1213  hypothetical protein  36.64 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0662  protein of unknown function DUF307  36.36 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06560  predicted membrane protein  39.55 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2854  hypothetical protein  38.17 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0738745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0401  protein of unknown function DUF307  47.42 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0102397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1934  protein of unknown function DUF307  41.86 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00173836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3203  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00131337  normal  0.0664467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0205  hypothetical protein  34.09 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1706  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0104  protein of unknown function DUF307  42.64 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0766582  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0661  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.11429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1473  hypothetical protein  37.01 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2804  protein of unknown function DUF307  37.31 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219169  normal  0.220669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2694  protein of unknown function DUF307  40.46 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2158  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000573014  normal  0.508781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00965  conserved inner membrane protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0139378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2682  protein of unknown function DUF307  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1070  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000025348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0233  hypothetical protein  35.11 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2635  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212303  hitchhiker  0.000000348703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2354  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.167767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00972  hypothetical protein  39.1 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.026608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1076  hypothetical protein  38.35 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1125  hypothetical protein  38.35 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00381989  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6516  protein of unknown function DUF307  41.09 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1121  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1150  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.452098  normal  0.540601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1822  hypothetical protein  37.4 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal  0.65949 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0922  hypothetical protein  36.09 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2585  hypothetical protein  42.06 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000439063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0680  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.945663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0680  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1525  protein of unknown function DUF307  36.3 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0967  protein of unknown function DUF307  41.75 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1439  protein of unknown function DUF307  28.91 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00732681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>