91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1505 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  98.84 
 
 
259 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  96.14 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  92.66 
 
 
259 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  92.28 
 
 
259 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  91.89 
 
 
259 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  92.28 
 
 
259 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  90.35 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  77.99 
 
 
264 aa  427  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  79.6 
 
 
257 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  75.78 
 
 
257 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  79.44 
 
 
257 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  79.54 
 
 
257 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  77.99 
 
 
257 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  72.66 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 
251 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  60.66 
 
 
244 aa  291  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  53.23 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
253 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  52.42 
 
 
253 aa  278  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
287 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
287 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
287 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
287 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  52.82 
 
 
287 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  52.02 
 
 
253 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  54.81 
 
 
244 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  54.81 
 
 
244 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  54.81 
 
 
244 aa  272  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  52.46 
 
 
245 aa  271  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  49.8 
 
 
263 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  48.63 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  53.04 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  46.99 
 
 
256 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  49.19 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  51.68 
 
 
256 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 
250 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  52.27 
 
 
228 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  49.4 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  45.6 
 
 
257 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  45.83 
 
 
250 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  44.18 
 
 
253 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  44.17 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  46.19 
 
 
249 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  39.92 
 
 
241 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  44.68 
 
 
246 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  44.12 
 
 
246 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  44.12 
 
 
246 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  45.11 
 
 
242 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  44.68 
 
 
242 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  44.26 
 
 
242 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  44.26 
 
 
242 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  44.68 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  40.6 
 
 
242 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  34.62 
 
 
268 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  43.33 
 
 
261 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  42.8 
 
 
240 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  32.39 
 
 
250 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  44.14 
 
 
240 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  34.68 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  32.39 
 
 
212 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  24.9 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  27.63 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  24.07 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  28.05 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  25.56 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  23.86 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  27.69 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  30.97 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  25.86 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  27.5 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  24.79 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  23.72 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  22.22 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  29.24 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  21.89 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  22.86 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  24.9 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  24 
 
 
217 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  21.62 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  29.21 
 
 
252 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  23.46 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.436714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>