48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0656 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000101119  normal  0.209543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3366  hypothetical protein  99.19 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000215688  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0655  hypothetical protein  98.39 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3983  hypothetical protein  91.87 
 
 		 124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3714  hypothetical protein  81.3 
 
 		 204 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000655627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3837  hypothetical protein  81.3 
 
 		 150 aa  213  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298104  hitchhiker  0.00217441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3655  hypothetical protein  81.3 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000914261  hitchhiker  0.00000165817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0682  hypothetical protein  81.3 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000132631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0791  hypothetical protein  79.67 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0645  hypothetical protein  58.87 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00602467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0969  hypothetical protein  56.67 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0841  hypothetical protein  55.65 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0619  hypothetical protein  55 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000809735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2907  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0828  hypothetical protein  48.78 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00283176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0928  hypothetical protein  54.03 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000245839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03438  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0134  hypothetical protein  36.8 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1513  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135628  hitchhiker  0.000151477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3552  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3727  hypothetical protein  42.5 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1389  hypothetical protein  40.83 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2591  hypothetical protein  39.2 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002571  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000160923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0640  hypothetical protein  41.46 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0683  hypothetical protein  39.34 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0129  hypothetical protein  38.52 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0175  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0413921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0191  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000796415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0175  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0183  hypothetical protein  38.21 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0179  hypothetical protein  39.34 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3358  hypothetical protein  39.34 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000532345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1027  hypothetical protein  39.34 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3486  hypothetical protein  39.34 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000145157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0667  hypothetical protein  38.52 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000546212  normal  0.390681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00118  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000974405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0121  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0756239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3483  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000106382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00117  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000369224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0126  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000088286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0112  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.7804e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3540  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000680081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0123  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.5031e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0826  hypothetical protein  33.06 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2897  hypothetical protein  31.4 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.223027  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0703  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4007  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>