23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0290 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0290  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  453  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131635  hitchhiker  0.00000068572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3729  CHAP domain-containing protein  96.76 
 
 		 237 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0290  CHAP domain-containing protein  91.12 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.703632  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4418  trypanothione synthetase domain-containing protein  81.68 
 
 		 221 aa  357  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0405  CHAP domain-containing protein  71.74 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.103507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.94 
 
 		 618 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  30.53 
 
 		 629 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3312  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.03 
 
 		 618 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3321  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.03 
 
 		 618 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3386  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.03 
 
 		 618 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.696441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.03 
 
 		 618 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 620 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0216  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  33.33 
 
 		 625 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02813  hypothetical protein  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02864  fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3168  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  32.65 
 
 		 619 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  28.24 
 
 		 642 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>