15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0071 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  98.84 
 
 		 86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  97.67 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  75.29 
 
 		 81 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  68.18 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  67.05 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  67.05 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  66.67 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  65.52 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  38.82 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  39.76 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  41.07 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>