108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4294 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0256  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.733763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  97.14 
 
 		 373 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  57.97 
 
 		 374 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  57.97 
 
 		 374 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  57.97 
 
 		 290 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  57.97 
 
 		 374 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  57.97 
 
 		 374 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  55.07 
 
 		 370 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  52.17 
 
 		 373 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3081  transposase, IS4  45.71 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.373868  normal  0.699478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 253 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  41.43 
 
 		 253 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 253 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  41.43 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  41.43 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  41.43 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  42.86 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  41.43 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  40 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0751  ISEc2, transposase  40 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000185341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0730  ISEc2, transposase  40 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  40 
 
 		 390 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  40 
 
 		 378 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 377 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  40 
 
 		 378 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  38.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  38.57 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  37.14 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  37.14 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  34.85 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  31.58 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  40.35 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  40.35 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  40.35 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  40.35 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0711  hypothetical protein  28.36 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0729  hypothetical protein  26.87 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0779  IS4 family transposase  35 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.44414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1672  IS4 family transposase  35 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.56828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  35 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0195  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0693  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0760  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0522474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0945  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00403728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1584  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1619  IS1548 transposase  40 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  29.51 
 
 		 367 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0818  hypothetical protein  34 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>