64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4235 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4235  virulence protein VsdF  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  60.78 
 
 
397 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  60.78 
 
 
397 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  60 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  55.32 
 
 
368 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  50.94 
 
 
381 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  49.06 
 
 
381 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  51.02 
 
 
384 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.17 
 
 
381 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3471  IS605 family transposase  35.37 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3437  IS605 family transposase  35.37 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3745  IS605 family transposase  35.37 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0235026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3700  transposase, IS605 family  35.37 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000048938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.17 
 
 
376 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  53.66 
 
 
416 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  39.22 
 
 
394 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.9 
 
 
372 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  42.86 
 
 
381 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  42.55 
 
 
377 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  58.33 
 
 
377 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  52.38 
 
 
402 aa  43.9  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.6 
 
 
461 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  34.15 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  34.15 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  52.38 
 
 
402 aa  43.9  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.78 
 
 
381 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  52.38 
 
 
402 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
369 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  58.82 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2836  transposase  40.82 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0267237  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  58.82 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2865  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.37 
 
 
370 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.931396  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
404 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  52.78 
 
 
408 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
394 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
394 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  36.49 
 
 
403 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
404 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2896  IS605 family transposase OrfB  46.51 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  42.86 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3199  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0945  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  42.55 
 
 
393 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1010  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5163  transposase, IS605 family  42.86 
 
 
376 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0472  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4575  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3476  IS605 family transposase  42.86 
 
 
379 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0814694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1098  IS605 family transposase  42.86 
 
 
376 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  34.94 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3042  IS605 family transposase OrfB  42.86 
 
 
376 aa  40.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 
362 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H02  transposase, family protein  37.5 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  42.86 
 
 
393 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  47.37 
 
 
367 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  42.86 
 
 
370 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  42.86 
 
 
393 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  42.86 
 
 
370 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.86 
 
 
370 aa  40  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
326 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>