171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4152 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4152  lipoprotein signal peptidase-like protein  100 
 
 		 113 aa  235  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  50.56 
 
 		 358 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  51.69 
 
 		 357 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  50.56 
 
 		 359 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  50.56 
 
 		 359 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  47.19 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  47.19 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  47.19 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  52.27 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  46.59 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  46.07 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  44.94 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  47.73 
 
 		 358 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  43.9 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  46.34 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  46.07 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  47.56 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  36.56 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  41.98 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  43.04 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.75 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  41.18 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  38.78 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.96 
 
 		 172 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  35.96 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.66 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.77 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.76 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.87 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  44.05 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  39.08 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  42.68 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.76 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  45.78 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.62 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  45.78 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  37.35 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  41.11 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>