18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3538 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3538  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3368  hypothetical protein  98.39 
 
 
248 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0585  hypothetical protein  97.18 
 
 
248 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0666  hypothetical protein  69.72 
 
 
242 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3690  hypothetical protein  69.72 
 
 
242 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766.1  hypothetical protein  88.89 
 
 
189 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0687  hypothetical protein  68.92 
 
 
242 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0697  hypothetical protein  68.53 
 
 
242 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1248  hypothetical protein  42.86 
 
 
258 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.591424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1143  hypothetical protein  41.33 
 
 
295 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000972481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1348  hypothetical protein  41.18 
 
 
258 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00722512  decreased coverage  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1156  hypothetical protein  45.98 
 
 
277 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3410  hypothetical protein  29.86 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2544  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3934  hypothetical protein  27.43 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3228  hypothetical protein  26.29 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1207  hypothetical protein  25.48 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33810  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>