179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2093 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2093  transposase  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  54.79 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  54.43 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  56.25 
 
 		 167 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  56.25 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  56.25 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  56.25 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  53.42 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  53.42 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  52.05 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  52.05 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  52.05 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  53.42 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  53.42 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  51.9 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  52.56 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  52.56 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  50.68 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  50.68 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  53.42 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  53.73 
 
 		 492 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  52.56 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  52.56 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  53.42 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  52.05 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  52.05 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  52.05 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  52.05 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  52.05 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  48.75 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  55 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  51.25 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  51.28 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  55 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  55 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  55 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  55 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  47.44 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  50 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  49.32 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  49.32 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4440  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5065  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5345  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5556  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  53.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  51.25 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2097  hypothetical protein  47.3 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230614  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  53.75 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  50.68 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  52.5 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  45.21 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.21 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  47.22 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5654  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5988  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000845611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  47.22 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4729  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  47.22 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  47.22 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1313  hypothetical protein  61.7 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1861  hypothetical protein  56.86 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1203  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>