34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1839 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1839  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.841987  normal  0.233297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2189  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.82 
 
 
261 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3247  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1860  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.75 
 
 
262 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.688645  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2036  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38 
 
 
278 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1987  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.75 
 
 
262 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1788  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.82 
 
 
226 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01930  possible peptidase  34.31 
 
 
207 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.89 
 
 
399 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  25.42 
 
 
379 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  28.97 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
588 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  29.9 
 
 
255 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.75 
 
 
841 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.92 
 
 
257 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.91 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  27.23 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.98 
 
 
843 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.24 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.06 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.79 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.57 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.85 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 
253 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  27.85 
 
 
660 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  30.27 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.78 
 
 
474 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.7 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  26.34 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  24.32 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.01 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  28.97 
 
 
543 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>