57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2733 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1670  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1353  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1443  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1068  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0011  streptothricin acetyltransferase  42.19 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.71 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.193233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1080  Prolyl aminopeptidase  40.32 
 
 
331 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0538  acetyltransferase  36.76 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.366943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2150  acetyltransferase  40.32 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000318542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2639  acetyltransferase  32.86 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0724929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.63 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  32.76 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  31.67 
 
 
185 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.99 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0316  ribosomal protein-alanine-acetyltransferase  38.89 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0238467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  31.67 
 
 
184 aa  42  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  31.67 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  26.6 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
151 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0610  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
85 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 
176 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
151 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.48 
 
 
311 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  25.97 
 
 
142 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  32.76 
 
 
185 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10971  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.92 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0263282  normal  0.176049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.78 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  25.37 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1979  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000336011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1153  acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.78 
 
 
378 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.12 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.74 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.68 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1820  acetyltransferase  27.27 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
191 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
154 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>