41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2210 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2210  proprotein convertase, P  100 
 
 		 403 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.163258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 		 835 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.84 
 
 		 836 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  37.17 
 
 		 818 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.97 
 
 		 835 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.97 
 
 		 835 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  35.35 
 
 		 840 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  30.36 
 
 		 1151 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.95 
 
 		 823 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.64 
 
 		 805 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.64 
 
 		 805 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.64 
 
 		 809 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.94 
 
 		 1363 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 		 1158 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.38 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1093 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  37.25 
 
 		 794 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.58 
 
 		 803 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 		 819 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 		 819 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 		 819 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.01 
 
 		 819 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  36.27 
 
 		 677 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  34.95 
 
 		 803 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  34.65 
 
 		 807 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.07 
 
 		 519 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  37.97 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.84 
 
 		 1367 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.98 
 
 		 818 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 		 802 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  26.2 
 
 		 947 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 		 807 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.55 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  35.14 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 		 703 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.2 
 
 		 703 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.06 
 
 		 1147 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>