More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2027 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000246944  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  94.96 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  94.14 
 
 		 371 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  89.12 
 
 		 371 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  89.12 
 
 		 371 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  88.7 
 
 		 371 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  92.86 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  88.7 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  87.45 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  87.45 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  87.45 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  87.45 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  88.24 
 
 		 370 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  89.12 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  86.97 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  78.24 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003881  alanine dehydrogenase  78.66 
 
 		 374 aa  353  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00759267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01795  alanine dehydrogenase  77.82 
 
 		 374 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1839  alanine dehydrogenase  77.31 
 
 		 372 aa  343  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  74.48 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  66.95 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  66.26 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  65.27 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  66.11 
 
 		 371 aa  315  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  66.11 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  66.95 
 
 		 372 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  66.53 
 
 		 371 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2761  alanine dehydrogenase  68.91 
 
 		 372 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  65.13 
 
 		 372 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  63.64 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  67.23 
 
 		 374 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  63.6 
 
 		 373 aa  291  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  62.76 
 
 		 371 aa  291  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  63.6 
 
 		 373 aa  291  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  62.76 
 
 		 373 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3686  L-alanine dehydrogenase  65.13 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4159  alanine dehydrogenase  66.81 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  61.76 
 
 		 369 aa  281  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  68.4 
 
 		 373 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  61.76 
 
 		 369 aa  281  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1428  L-alanine dehydrogenase  63.6 
 
 		 371 aa  278  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.524498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  58.58 
 
 		 371 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7155  alanine dehydrogenase  60.25 
 
 		 372 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  56.12 
 
 		 372 aa  275  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  58.8 
 
 		 370 aa  275  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  60.67 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  55.23 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  55.23 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  58.65 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  55.23 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  55.23 
 
 		 371 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  60.5 
 
 		 374 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  55.88 
 
 		 376 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  55.04 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 373 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0558  alanine dehydrogenase  65.52 
 
 		 371 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.87759  normal  0.209047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  56.3 
 
 		 371 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  61.21 
 
 		 372 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  61.21 
 
 		 372 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  60.25 
 
 		 371 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  61.21 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  59.66 
 
 		 377 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  57.76 
 
 		 371 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  57.74 
 
 		 377 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1682  L-alanine dehydrogenase  67.36 
 
 		 371 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 370 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 370 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  73.8 
 
 		 323 aa  262  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  59.41 
 
 		 371 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  60.67 
 
 		 371 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  59.41 
 
 		 371 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  60.67 
 
 		 371 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 377 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  57.14 
 
 		 370 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  59 
 
 		 371 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  56.9 
 
 		 377 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  53.14 
 
 		 371 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  56.9 
 
 		 377 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  60.17 
 
 		 373 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  57.32 
 
 		 377 aa  258  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  57.74 
 
 		 371 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  60.87 
 
 		 341 aa  257  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>