25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1919 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000279845  unclonable  0.00000180223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2335  hypothetical protein  93.15 
 
 		 73 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000105351  hitchhiker  0.0000624788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2241  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298712  decreased coverage  0.0000000000318676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2193  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000518163  unclonable  0.00000337202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2143  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000396771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2228  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000064451  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4514  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1912  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01342  hypothetical protein  79.45 
 
 		 73 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004123  hypothetical protein  78.08 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2137  hypothetical protein  91.78 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  decreased coverage  0.00000562617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1941  hypothetical protein  91.78 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000325932  hitchhiker  0.00146618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2034  hypothetical protein  91.78 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  hitchhiker  0.000113155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1879  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000415752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2332  hypothetical protein  91.78 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1684  hypothetical protein  75.34 
 
 		 73 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000424773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1703  hypothetical protein  86.3 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000908952  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0836  hypothetical protein  75.34 
 
 		 73 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2272  hypothetical protein  91.78 
 
 		 73 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2053  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000543935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1988  hypothetical protein  84.93 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2150  hypothetical protein  52.86 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0876  hypothetical protein  57.53 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.624491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1578  hypothetical protein  60.27 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01087  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000821467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>