More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1818 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  57.5 
 
 		 577 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  58.17 
 
 		 577 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  59.66 
 
 		 580 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  58.38 
 
 		 577 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000155632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  58.02 
 
 		 577 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000100505  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  57.77 
 
 		 543 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000159451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  58.2 
 
 		 577 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000149813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  58.2 
 
 		 577 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  100 
 
 		 569 aa  1169    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  58.17 
 
 		 582 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  58.17 
 
 		 582 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000299604  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  58.35 
 
 		 582 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000644541  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  56.64 
 
 		 570 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  54.37 
 
 		 599 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000127268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  55.67 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  54.39 
 
 		 576 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000440956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  42.05 
 
 		 809 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  37.62 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  40.64 
 
 		 786 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  37.62 
 
 		 817 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  42.02 
 
 		 800 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  40.69 
 
 		 786 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  38.04 
 
 		 546 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000734026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.43 
 
 		 802 aa  291  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  40.59 
 
 		 829 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  40.31 
 
 		 806 aa  289  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.58 
 
 		 810 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  36.73 
 
 		 818 aa  287  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  41.16 
 
 		 807 aa  286  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.9 
 
 		 805 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.9 
 
 		 805 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  40.9 
 
 		 805 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.9 
 
 		 805 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  39.73 
 
 		 811 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  39.47 
 
 		 795 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  34.97 
 
 		 811 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  39.84 
 
 		 806 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  39.27 
 
 		 811 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.87 
 
 		 801 aa  280  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  38.5 
 
 		 815 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  38.96 
 
 		 812 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  40.11 
 
 		 786 aa  280  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  34.75 
 
 		 827 aa  280  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  37.9 
 
 		 844 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  36.6 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  39.67 
 
 		 809 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.47 
 
 		 816 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.37 
 
 		 843 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.53 
 
 		 806 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  38.9 
 
 		 805 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  41.87 
 
 		 832 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  37.01 
 
 		 803 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  38.9 
 
 		 805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  40.35 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  37.81 
 
 		 660 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.64 
 
 		 805 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  40.16 
 
 		 546 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  35.46 
 
 		 813 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  38.48 
 
 		 589 aa  273  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000072938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  34.79 
 
 		 814 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  35.89 
 
 		 795 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  38.44 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  39.34 
 
 		 590 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164824  decreased coverage  0.000000603795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  36.82 
 
 		 799 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  41.97 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  41.97 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  41.97 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.38 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  39.2 
 
 		 812 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  39.2 
 
 		 812 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.5 
 
 		 865 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  37.81 
 
 		 813 aa  267  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  35.53 
 
 		 831 aa  267  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  39.2 
 
 		 812 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  35.54 
 
 		 798 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  33.88 
 
 		 821 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.28 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  37.14 
 
 		 589 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  36.34 
 
 		 811 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  39.79 
 
 		 791 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  34.33 
 
 		 861 aa  264  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  37.76 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000947515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.07 
 
 		 810 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.83 
 
 		 805 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  32.91 
 
 		 798 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.47 
 
 		 805 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  40.12 
 
 		 810 aa  259  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.18 
 
 		 788 aa  259  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  39.33 
 
 		 808 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  36.93 
 
 		 777 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  36 
 
 		 801 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  33.26 
 
 		 819 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  34.95 
 
 		 786 aa  256  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  36.03 
 
 		 784 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  38.76 
 
 		 555 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.43 
 
 		 813 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  32.91 
 
 		 823 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  33.05 
 
 		 819 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  35.9 
 
 		 803 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  35.29 
 
 		 825 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>