18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1156 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1348  hypothetical protein  46.21 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00722512  decreased coverage  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1248  hypothetical protein  42.29 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.591424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0687  hypothetical protein  41.44 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0697  hypothetical protein  41.06 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3690  hypothetical protein  41.06 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0666  hypothetical protein  41.06 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3368  hypothetical protein  45.91 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0585  hypothetical protein  45.09 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3538  hypothetical protein  45.98 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1143  hypothetical protein  44.98 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000972481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766.1  hypothetical protein  45.31 
 
 		 189 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3410  hypothetical protein  35.32 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2544  hypothetical protein  27.08 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33810  hypothetical protein  27.67 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3228  hypothetical protein  26.71 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3934  hypothetical protein  30.87 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1207  hypothetical protein  25.66 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>