More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0458 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4518  PhoH family protein  70.72 
 
 		 478 aa  668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0576  PhoH family protein  84.27 
 
 		 464 aa  798    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002391  PhoH family protein  68.75 
 
 		 458 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0536  PhoH family protein  84.48 
 
 		 464 aa  799    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4323  PhoH family protein  91.59 
 
 		 464 aa  884    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  84.48 
 
 		 464 aa  799    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0458  PhoH family protein  100 
 
 		 464 aa  959    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.774796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3301  PhoH family protein  83.41 
 
 		 464 aa  791    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03677  hypothetical protein  68.53 
 
 		 458 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2090  hypothetical protein  68.95 
 
 		 458 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3732  PhoH family protein  84.48 
 
 		 464 aa  799    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0537  PhoH-like protein  81.68 
 
 		 464 aa  784    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.874296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3915  PhoH family protein  84.48 
 
 		 464 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0626  PhoH family protein  89.01 
 
 		 464 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0576  PhoH family protein  84.05 
 
 		 464 aa  796    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3454  PhoH family protein  84.05 
 
 		 464 aa  796    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3507  PhoH family protein  81.9 
 
 		 464 aa  778    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0575  PhoH family protein  84.05 
 
 		 464 aa  796    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3130  PhoH family protein  84.91 
 
 		 463 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3703  PhoH family protein  86.42 
 
 		 464 aa  818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3829  PhoH-like protein  69.7 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0815291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03696  PhoH family protein  67.52 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1040  PhoH family protein  51.48 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11240  PhoH-like protein  50.66 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.653807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  50.55 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1189  hypothetical protein  49.89 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.541896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13190  hypothetical protein  49.89 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0491409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1066  PhoH-like protein  50.55 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.128734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1033  PhoH family protein  49.23 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0963  PhoH-like protein  49.67 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4558  PhoH family protein  49.67 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0898  PhoH family protein  49.89 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0886799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  49.68 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1291  PhoH family protein  48.58 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4434  PhoH family protein  48.58 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.879472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  43.5 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  43.52 
 
 		 469 aa  359  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2901  hypothetical protein  42.58 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  42.37 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  43.07 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  44.16 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  42.52 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  42.15 
 
 		 605 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  42.61 
 
 		 561 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  43.31 
 
 		 587 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  43.31 
 
 		 587 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  42.92 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  43.43 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  41.45 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  40.62 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  42.19 
 
 		 562 aa  332  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  42.04 
 
 		 573 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  42.14 
 
 		 564 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  41.47 
 
 		 572 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  40.72 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  42.52 
 
 		 567 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  41.3 
 
 		 575 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  41.3 
 
 		 575 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  41.35 
 
 		 601 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  39.83 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  39.83 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  40.79 
 
 		 631 aa  320  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  40.88 
 
 		 606 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  41.42 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  39.61 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  41.42 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  41.42 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  41.42 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  40.76 
 
 		 600 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  40.76 
 
 		 600 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  40.79 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  40.79 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  40.76 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  40.3 
 
 		 600 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  40.55 
 
 		 606 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  40.55 
 
 		 606 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  40.59 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  41.6 
 
 		 595 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  39.53 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  41.96 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  40.59 
 
 		 616 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  40.3 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  41.68 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  39.41 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  40.38 
 
 		 564 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  42.04 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  41.18 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  40.61 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2481  PhoH family protein  37.63 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  36.93 
 
 		 522 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  40.94 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2311  PhoH family protein  34.42 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.805307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10930  PhoH family protein  35.12 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3998  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.546265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3696  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3711  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4070  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3966  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4054  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1186  PhoH family protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.454967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>