189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3563 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0903  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  86.78 
 
 
410 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3684  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  97.84 
 
 
410 aa  816    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.040931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0749  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  87.74 
 
 
410 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3271  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  87.98 
 
 
410 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3377  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  85.82 
 
 
404 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3494  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  98.32 
 
 
410 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3404  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  83.08 
 
 
404 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240322  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3581  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  81.31 
 
 
404 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0755  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  98.8 
 
 
416 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0850  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  89.9 
 
 
410 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  79.57 
 
 
404 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3563  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  100 
 
 
416 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2708  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  76.92 
 
 
404 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000751888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3210  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  69.47 
 
 
404 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0909603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2980  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  68.03 
 
 
404 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3365  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.5 
 
 
399 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0681454  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.5 
 
 
399 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0925  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.5 
 
 
399 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3437  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.5 
 
 
399 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0567111  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1104  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.25 
 
 
399 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3616  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.87 
 
 
399 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.098981  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0937  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.75 
 
 
399 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0975  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.75 
 
 
399 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0939  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.75 
 
 
399 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0245793  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0941  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.75 
 
 
399 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0631633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0950  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  57.45 
 
 
399 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0145301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2538  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  54.3 
 
 
399 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0236214  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3430  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  55.56 
 
 
399 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0895554  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0983  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.9 
 
 
399 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000264677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3102  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  55.83 
 
 
399 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.43 
 
 
402 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0465099  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2880  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  56.1 
 
 
399 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0453  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  52.8 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0193491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00746  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.88 
 
 
396 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1081  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.88 
 
 
400 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1712  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.32 
 
 
398 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361106  normal  0.0886494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1570  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  50.86 
 
 
411 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.871947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0812  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.78 
 
 
404 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1692  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.75 
 
 
412 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.269427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25305  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.37 
 
 
403 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0099  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.36 
 
 
410 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3316  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  49.76 
 
 
413 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000279294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3304  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  49.76 
 
 
413 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2161  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.37 
 
 
403 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  49.76 
 
 
413 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0954  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  53.85 
 
 
413 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841403  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2388  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  52.99 
 
 
400 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.883965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1596  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  50.76 
 
 
403 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000804374  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002708  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  49.14 
 
 
414 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000022376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2105  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  52.03 
 
 
411 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2425  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.78 
 
 
411 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0950  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  48.67 
 
 
414 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03274  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  48.07 
 
 
413 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  51.78 
 
 
403 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1930  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  50.38 
 
 
402 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1883  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  49.26 
 
 
415 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3416  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  48.75 
 
 
399 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.797327  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000806  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  48.7 
 
 
414 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744539  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06712  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  48.19 
 
 
450 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1798  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  47.01 
 
 
401 aa  338  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.726384  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2181  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  40.58 
 
 
399 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2537  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  41.11 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  41.39 
 
 
384 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2137  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  39.41 
 
 
384 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000007164  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0040  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  36.02 
 
 
409 aa  249  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12158  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  35.68 
 
 
411 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0550  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  38.25 
 
 
503 aa  136  5e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.481712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1664  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.93 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.74 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000923733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0212  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.18 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0013917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0062  NQR2 and RnfD family protein  33.83 
 
 
302 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0652  NQR2 and RnfD family protein  31.82 
 
 
295 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.114634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0837  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, B subunit  31.97 
 
 
338 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.16 
 
 
324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.56 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.19 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.08 
 
 
315 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0629  NQR2 and RnfD family protein  31.53 
 
 
313 aa  117  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00500765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.36 
 
 
325 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000145207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.68 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00551024  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0307  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.41 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0928728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.46 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.26 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.46 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.73 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.81 
 
 
327 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.3 
 
 
321 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  31.34 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  30.69 
 
 
350 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1734  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.05 
 
 
361 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.15 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  29.17 
 
 
349 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.88 
 
 
330 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.83 
 
 
326 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  29.17 
 
 
349 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  29.17 
 
 
349 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  28.85 
 
 
349 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  28.85 
 
 
349 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2403  electron transport complex protein RnfD  33.46 
 
 
357 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.469732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>