17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27970 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27970  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  371  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.924005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10588  hypothetical protein  42.63 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0734  hypothetical protein  41.34 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1460  hypothetical protein  41.11 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00443497  normal  0.661074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3259  hypothetical protein  34.32 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03310  hypothetical protein  31.9 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3552  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.333315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0503  hypothetical protein  27.75 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2986  transmembrane protein  32.53 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1258  hypothetical protein  29.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0374  hypothetical protein  29.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1869  hypothetical protein  29.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.369698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0776  hypothetical protein  29.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1091  hypothetical protein  29.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1250  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1028  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3990  transmembrane protein  30.94 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29118  normal  0.555253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>