More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23280  LSU ribosomal protein L15P  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.332048  hitchhiker  0.00000574627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  76.51 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  77.85 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  73.29 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50.67 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  55.03 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.6 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  48.65 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  54.05 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  54.73 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  54 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  53.42 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  52.74 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  54.48 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  54.55 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  53.42 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  52.35 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 170 aa  124  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.05 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 243 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  46.98 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  51.72 
 
 		 210 aa  120  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  46.75 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  49.32 
 
 		 144 aa  119  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  46.75 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  49.02 
 
 		 173 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>