More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21660  protein kinase family protein  100 
 
 
400 aa  818    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.285343  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21670  protein kinase family protein  39.77 
 
 
472 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.03192  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
566 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  33.83 
 
 
461 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  35.1 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  35.68 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  34.18 
 
 
500 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
861 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 
457 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
499 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  34.03 
 
 
457 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 
774 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  30.43 
 
 
403 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
667 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
480 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.52 
 
 
668 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
687 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.38 
 
 
653 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
652 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.97 
 
 
505 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3647  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
480 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  29.34 
 
 
1774 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 
551 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  28.81 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.34 
 
 
681 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1111  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
527 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0331309  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4513  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.228895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
526 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
582 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0395  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.6 
 
 
653 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  28.86 
 
 
583 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
1327 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.78 
 
 
620 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1816  Serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
718 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  30.49 
 
 
692 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.85 
 
 
707 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.7 
 
 
863 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
622 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.26 
 
 
627 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
651 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31 
 
 
584 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.25 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.07 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.6 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  31.88 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
519 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 
602 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.32 
 
 
638 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 
651 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3308  Serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 
601 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3310  Serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
563 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
520 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.3 
 
 
715 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
666 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  31.63 
 
 
667 aa  79  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.19 
 
 
650 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.95 
 
 
1358 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  36.73 
 
 
664 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 
612 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.73 
 
 
603 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.29 
 
 
618 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.12 
 
 
659 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  27.8 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 
576 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  26.57 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
1104 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.49 
 
 
668 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>