More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13330  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.29 
 
 
257 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
253 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
259 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  41.44 
 
 
260 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  41.06 
 
 
260 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
258 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  40.68 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  41.06 
 
 
260 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  39.16 
 
 
260 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
261 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.61 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
261 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
259 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  39.46 
 
 
267 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  38.93 
 
 
263 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.22 
 
 
258 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
258 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.084821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
257 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  40.08 
 
 
258 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
266 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  38.55 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.16 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  40 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  37.93 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.23 
 
 
268 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.16 
 
 
260 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
260 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
258 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  39.08 
 
 
263 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  39.08 
 
 
263 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  36.68 
 
 
255 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.22 
 
 
259 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  39.31 
 
 
264 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.4 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 
245 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0825  hypothetical protein  37.97 
 
 
258 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
255 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 
249 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
254 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
258 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2878  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  36.94 
 
 
271 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
258 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
274 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.08 
 
 
261 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1528  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  35.25 
 
 
245 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
253 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.22 
 
 
258 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  36.78 
 
 
262 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  36.5 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.47 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.15 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  37.02 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  34.09 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.26 
 
 
258 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
257 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
260 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
258 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
256 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.92 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.92 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.92 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.54 
 
 
248 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
254 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
264 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
251 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
246 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1200  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.48 
 
 
245 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354003  hitchhiker  0.00226725 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1057  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.48 
 
 
245 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
245 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
253 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  35.91 
 
 
256 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.1 
 
 
245 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
272 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
261 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.919564  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
248 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
255 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.63 
 
 
246 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
256 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  35 
 
 
262 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
255 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
248 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
253 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.09 
 
 
258 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
255 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>