More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12050  putative regulator of cell autolysis  100 
 
 		 490 aa  1011    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.236782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  37.82 
 
 		 1018 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  38.62 
 
 		 645 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  36.65 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 568 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.43 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 1016 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  31 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.29 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.87 
 
 		 576 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.03 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.36 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  33.78 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  35.57 
 
 		 325 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.96 
 
 		 340 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 338 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  33.92 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  30.21 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  34.4 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  32.31 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  24.94 
 
 		 603 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 654 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 572 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 362 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 581 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  31.42 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  31.82 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  31.42 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 564 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  30.87 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.27 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  32.17 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  29.34 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 559 aa  97.1  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  29.75 
 
 		 565 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 		 565 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  29.75 
 
 		 565 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 559 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 559 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 559 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 559 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 		 566 aa  96.7  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  29.75 
 
 		 559 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 581 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  25.73 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  29.91 
 
 		 587 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  31.45 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 559 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  30.77 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  32.37 
 
 		 582 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  28.28 
 
 		 563 aa  94  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  26.67 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  27.83 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 1022 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  27.98 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.62 
 
 		 568 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  33.03 
 
 		 262 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  28.99 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  28.51 
 
 		 612 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 		 389 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 357 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  32.89 
 
 		 339 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  32.89 
 
 		 339 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 559 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  32.89 
 
 		 339 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  29.31 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 355 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 561 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>