17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08940  cell division initiation protein  100 
 
 
287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.954318  hitchhiker  0.0000000349233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2081  DivIVA family protein  42.37 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  hitchhiker  0.0000000000174011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09410  DivIVA protein  33.11 
 
 
262 aa  143  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0738055  normal  0.126085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  42.19 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  26.41 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  28.35 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  43.33 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  25.91 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  34.38 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  27.12 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  24.29 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  26.73 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  38.98 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  29.03 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  38.98 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  25.13 
 
 
435 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  25.13 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>