24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08620 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08620  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000490301  hitchhiker  0.0000012455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09740  tRNA-Tyr  95.29 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000943193  hitchhiker  0.0000123318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>