More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02360  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 		 3022 bp  1396    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01560  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2947 bp  5842    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.550873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0013  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2969 bp  2744    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0756826  normal  0.599313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0045  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 2935 bp  1035    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.303465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08950  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 		 3022 bp  1396    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08390  23S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 2947 bp  5794    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00130  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 		 3022 bp  1396    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0038  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2969 bp  2744    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.620142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0055  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2969 bp  2744    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0373093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 2961 bp  607  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0056  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 3039 bp  563  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.826455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0020  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 3039 bp  563  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.944496  normal  0.114862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0012  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 3039 bp  563  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0471385  normal  0.17133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 3000 bp  547  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2928 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2927 bp  492  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2935 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2932 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 2933 bp  484  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 3116 bp  476  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 3129 bp  474  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 3129 bp  474  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 3129 bp  474  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 3129 bp  474  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 		 3105 bp  468  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 		 3105 bp  468  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 2897 bp  462  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 2897 bp  462  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 2897 bp  462  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 2898 bp  462  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 		 2897 bp  462  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0024  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2740 bp  454  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 3108 bp  452  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 3108 bp  452  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0029  23S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 3109 bp  448  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655069  decreased coverage  0.000196644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0023  23S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 3109 bp  448  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0016  23S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 3109 bp  448  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06920  23S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10560  23S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491594  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22210  23S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790169  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37130  23S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.756619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2913 bp  440  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2913 bp  440  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0023  23S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 2997 bp  436  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0049  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 3121 bp  436  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0039  23S ribosomal RNA  85.63 
 
 		 2921 bp  436  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.409149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0051  23S ribosomal RNA  85.63 
 
 		 2921 bp  436  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0006  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 3121 bp  436  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0313545  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0066  23S ribosomal RNA  85.63 
 
 		 2921 bp  436  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0058  23S ribosomal RNA  85.63 
 
 		 2921 bp  436  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0028  23S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 3122 bp  436  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 2774 bp  432  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 2774 bp  432  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2861 bp  432  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2861 bp  432  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2861 bp  432  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 2774 bp  432  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0069  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2605 bp  430  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2909 bp  428  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  85.14 
 
 		 2907 bp  428  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2758 bp  428  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2758 bp  428  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2758 bp  428  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 2758 bp  428  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2875 bp  430  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>