28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0060 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000474185  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0030  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0160344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0020  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0002  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000973138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0077  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0054  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0024  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0009  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0036  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0219325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0060  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0032  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.717284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4575  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0595904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0012  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>