More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3073 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3073  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  977    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1602  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase I (NADP+) (SSDH)  43.13 
 
 
479 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
475 aa  363  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
479 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.66 
 
 
480 aa  335  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.85 
 
 
482 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.35 
 
 
482 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
484 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
482 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
483 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
490 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
482 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
482 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
484 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
482 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
482 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
483 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
490 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
499 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
499 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
489 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.44 
 
 
486 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.33 
 
 
491 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.32 
 
 
483 aa  326  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 
485 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
496 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
483 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
500 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
500 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.14 
 
 
483 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
490 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.67 
 
 
483 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
483 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.63 
 
 
482 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
495 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.26 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.41 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.41 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.41 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.67 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.41 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.2 
 
 
482 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
484 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.91 
 
 
483 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.91 
 
 
483 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.91 
 
 
483 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.8 
 
 
482 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.27 
 
 
482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.27 
 
 
482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.27 
 
 
482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.27 
 
 
482 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.67 
 
 
483 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
486 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
503 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.66 
 
 
483 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.67 
 
 
483 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.91 
 
 
483 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
509 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
489 aa  319  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
482 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
493 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
489 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
488 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.47 
 
 
483 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
497 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.91 
 
 
483 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.41 
 
 
483 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.63 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
489 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2257  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
485 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0423059  normal  0.499743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
503 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
482 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
489 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  40.87 
 
 
497 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
482 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
488 aa  316  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
481 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.18 
 
 
490 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.79 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.93 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>