212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2696 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2696  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.81 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.16 
 
 
206 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  40.5 
 
 
216 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  40 
 
 
222 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  39.9 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  40.32 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  37.02 
 
 
222 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.71 
 
 
239 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  39.38 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  37.06 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  39.13 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  35.26 
 
 
253 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  39.9 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  38.14 
 
 
235 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  38.66 
 
 
219 aa  136  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  38.74 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  36.6 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  37.04 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  36.08 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  37.82 
 
 
224 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  38.58 
 
 
225 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  35.64 
 
 
215 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  37.95 
 
 
200 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  36.27 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  38.58 
 
 
200 aa  131  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  36.79 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  32.42 
 
 
238 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  36.6 
 
 
199 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.221672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  33.64 
 
 
255 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0309  RnfA-Nqr electron transport subunit  35.75 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  36.79 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  36.71 
 
 
244 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  40.98 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  35.71 
 
 
244 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  35.82 
 
 
203 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  36.32 
 
 
231 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  35.71 
 
 
244 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  34.1 
 
 
230 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0064  RnfA-Nqr electron transport subunit  34.8 
 
 
203 aa  122  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  33.97 
 
 
224 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  32.38 
 
 
263 aa  121  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  34.91 
 
 
230 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  35.55 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  36.19 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0650  RnfA-Nqr electron transport subunit  35.45 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.338076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  34.26 
 
 
228 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  34.87 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  34.65 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  34.3 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0631  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit D  34.52 
 
 
203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0954495  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  37.89 
 
 
219 aa  118  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  36.14 
 
 
230 aa  117  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  33.96 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  35.35 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  36.77 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  33.33 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  34.6 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  32.09 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  31.31 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  34.58 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0952  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  34.72 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  33.64 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  34.12 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  34.12 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  33.33 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  34.6 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  34.12 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  34.6 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  35.21 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  35.21 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  35.07 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  34.83 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  34.54 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00240188  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0038  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  35.27 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  33.66 
 
 
228 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2978  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  33.01 
 
 
208 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  36.1 
 
 
232 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  35.55 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  34.93 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  36.89 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  35.21 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  32.39 
 
 
228 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002710  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  32.99 
 
 
210 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  32.08 
 
 
230 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  35.47 
 
 
232 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  32.47 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  30.88 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  34.69 
 
 
238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  32.39 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  30.88 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  30.88 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  34.13 
 
 
218 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0939  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  33.16 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0695822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0977  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  33.16 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.274009  normal  0.954509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3208  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  30.96 
 
 
206 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0941  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  33.16 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  35.11 
 
 
208 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0656871  normal  0.956301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3560  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  32.65 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0385705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3363  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  32.65 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0981921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>