14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0247 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0247  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1848  hypothetical protein  43.9 
 
 
271 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1933  hypothetical protein  43.5 
 
 
271 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2030  hypothetical protein  43.09 
 
 
270 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1779  hypothetical protein  42.86 
 
 
287 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3033  hypothetical protein  37.55 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.298103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1993  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000706568  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2009  hypothetical protein  34.8 
 
 
429 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000896704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2528  hypothetical protein  32.99 
 
 
383 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0804  hypothetical protein  33.2 
 
 
302 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352639  normal  0.655228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2081  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  23.83 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  20 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0790  hypothetical protein  22.22 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.112089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>