48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3947 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3947  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  359  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3624  hypothetical protein  69.95 
 
 		 182 aa  241  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4728  hypothetical protein  65.22 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4001  hypothetical protein  63.59 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4114  hypothetical protein  64.13 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3911  hypothetical protein  63.74 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3909  hypothetical protein  64.13 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307626  normal  0.259265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4491  hypothetical protein  64.52 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4294  hypothetical protein  64.52 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113547  unclonable  0.00000000000444026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4349  hypothetical protein  64.52 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0237894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0049  hypothetical protein  63.98 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3718  hypothetical protein  60.67 
 
 		 177 aa  191  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0055  hypothetical protein  58.79 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714058  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0098  hypothetical protein  58.47 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0092  hypothetical protein  58.79 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0634394  hitchhiker  0.000108665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0089  hypothetical protein  55.98 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00261813  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4162  protein of unknown function DUF414  41.73 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2404  hypothetical protein  35.2 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0209  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.5056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3965  protein of unknown function DUF414  38.26 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00236039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4100  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128522  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4193  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0025  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0023  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00725137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4249  hypothetical protein  41.18 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.236524  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4340  hypothetical protein  40.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00410643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03700  hypothetical protein  40.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00344237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4515  hypothetical protein  39.68 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4121  protein of unknown function DUF414  40.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.911509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4885  hypothetical protein  40.68 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0120647  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4384  hypothetical protein  40.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000152242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4091  hypothetical protein  40.2 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000474689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03751  hypothetical protein  40.2 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00334107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4150  hypothetical protein  40.2 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0626838  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5311  hypothetical protein  39.22 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658573  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4392  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4235  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000760229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4214  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.831944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4331  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0353263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4285  hypothetical protein  44.71 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0130421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4225  hypothetical protein  39.23 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0915733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0012  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.91121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00579  hypothetical protein  33.76 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0231  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001913  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0470  hypothetical protein  32.84 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00012  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4825  hypothetical protein  27.84 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>