16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2455 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1160  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1354  hypothetical protein  49.23 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1319  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1310  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1346  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3040  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.975749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1252  hypothetical protein  51.61 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.745034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1146  hypothetical protein  61.22 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1241  hypothetical protein  50.75 
 
 		 73 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2460  hypothetical protein  48.39 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1487  hypothetical protein  58.33 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2764  hypothetical protein  55.1 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0224355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2940  hypothetical protein  41.43 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2842  hypothetical protein  45 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2284  hypothetical protein  48.89 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.115994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>