78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2261 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2261  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1746  hypothetical protein  81.82 
 
 		 205 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1602  hypothetical protein  81.82 
 
 		 205 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00444605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1677  hypothetical protein  81.31 
 
 		 205 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260376  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2634  hypothetical protein  81.82 
 
 		 205 aa  329  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2472  hypothetical protein  80.81 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000127559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1872  hypothetical protein  80.3 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000337406  hitchhiker  0.00000947972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2479  hypothetical protein  80.3 
 
 		 205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000487251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2592  hypothetical protein  80.3 
 
 		 205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00225749  normal  0.0485502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1559  hypothetical protein  77.27 
 
 		 205 aa  323  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000960005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2539  hypothetical protein  76.26 
 
 		 205 aa  323  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2234  hypothetical protein  79.8 
 
 		 205 aa  321  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2706  hypothetical protein  76.38 
 
 		 204 aa  317  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0532823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1880  hypothetical protein  75.25 
 
 		 204 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1827  hypothetical protein  73.21 
 
 		 211 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2063  hypothetical protein  76.41 
 
 		 204 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000421007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02369  hypothetical protein  50.26 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0518841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2196  hypothetical protein  48.48 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2380  hypothetical protein  45.45 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.386361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0962  hypothetical protein  48.22 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003856  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.489271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01823  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0645  hypothetical protein  42.93 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2901  hypothetical protein  45.85 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2852  hypothetical protein  43.65 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.954826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1719  hypothetical protein  43.65 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1611  hypothetical protein  43.65 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1868  hypothetical protein  43.72 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2153  hypothetical protein  42.71 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0117642  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1295  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2471  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1252  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01138  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2515  protein of unknown function DUF489  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0030119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01130  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1993  hypothetical protein  42.21 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1593  hypothetical protein  41.71 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1310  hypothetical protein  41.71 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1334  hypothetical protein  40.7 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1350  hypothetical protein  40.7 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2021  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1312  hypothetical protein  40.7 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2133  hypothetical protein  40.7 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0109581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1951  hypothetical protein  40.7 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1594  hypothetical protein  44.85 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1763  hypothetical protein  38.69 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.173363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2041  hypothetical protein  38.69 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1645  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1267  protein of unknown function DUF489  38.34 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2064  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.890726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1941  hypothetical protein  39.18 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3266  hypothetical protein  36.27 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3359  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3191  hypothetical protein  36.98 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.140905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1676  hypothetical protein  35.83 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3597  hypothetical protein  36.98 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2400  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00786814  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1818  hypothetical protein  35.38 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.112732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4015  hypothetical protein  35.38 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0201  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0760616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1918  hypothetical protein  36.45 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3419  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3620  hypothetical protein  35.38 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30140  hypothetical protein  35.05 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1843  hypothetical protein  37.17 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28370  hypothetical protein  35.57 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2580  hypothetical protein  36.17 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1098  hypothetical protein  30.81 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1452  hypothetical protein  36.08 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06141  hypothetical protein  32.99 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01025  hypothetical protein  32.99 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0782  hypothetical protein  33.86 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0695  hypothetical protein  32.8 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.596389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2445  hypothetical protein  31.31 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1405  hypothetical protein  32.82 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0923  hypothetical protein  29.23 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1042  hypothetical protein  29.23 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1949  protein of unknown function DUF489  27.89 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>