45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2096 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  64 
 
 		 152 aa  203  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  70.63 
 
 		 131 aa  187  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  64.34 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  57.53 
 
 		 148 aa  184  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  62.6 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  43.51 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  49.57 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  43.08 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  50 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  45.3 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  36.18 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  42.34 
 
 		 306 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 270 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  46.67 
 
 		 254 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  41.13 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  39.46 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  37.91 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  38.41 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  36.52 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  37.1 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  37.38 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  37.38 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  37.38 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  37.86 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  37.86 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  36.22 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  39.36 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  37.38 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  32.38 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  41.77 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  31.86 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  40.86 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  29.69 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  43.08 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  28.71 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  28.69 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  33.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>