79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1803 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1803  DsrE family protein  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1808  DsrE-like protein  72.09 
 
 		 138 aa  203  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000348316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2314  DsrE family protein  66.67 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000295076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2200  sulfur relay protein TusD/DsrE  65.89 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000731286  normal  0.0885071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2206  DsrE family protein  65.89 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2002  DsrE family protein  62.02 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000724121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2165  DsrE family protein  65.12 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000184958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2059  DsrE family protein  62.02 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0188592  hitchhiker  0.000335265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2004  DsrE family protein  62.02 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1972  DsrE family protein  62.02 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000573125  normal  0.68852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2135  DsrE family protein  59.69 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293804  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2474  sulfur relay protein TusD/DsrE  62.02 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000110001  hitchhiker  0.0000982729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2376  dsrE-related protein  61.24 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2110  DsrE family protein  59.69 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000251046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2015  DsrE family protein  55.04 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000123098  hitchhiker  0.00302042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1781  DsrE-related protein  53.49 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111826  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002294  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusD  45.04 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00060  sulfur transfer complex subunit TusD  44.44 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0307  sulfur transfer complex subunit TusD  46.77 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0180937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3443  intracellular sulfur oxidation protein of DsrE family protein  44.88 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0125489  decreased coverage  0.0000256073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4013  sulfur transfer complex subunit TusD  44.19 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0324388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0368  sulfur transfer complex subunit TusD  44.62 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0265289  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0368  sulfur relay protein TusD/DsrE  44.62 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1635  sulfur transfer complex subunit TusD  42.06 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0395  sulfur transfer complex subunit TusD  43.41 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3819  sulfur transfer complex subunit TusD  42.31 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000709397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4654  sulfur transfer complex subunit TusD  42.52 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000614483  normal  0.0147781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03196  hypothetical protein  43.08 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000210262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3626  sulfur transfer complex subunit TusD  43.85 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000441818  hitchhiker  0.000993351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03147  hypothetical protein  43.08 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000155048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4554  sulfur transfer complex subunit TusD  41.86 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178436  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3814  sulfur transfer complex subunit TusD  43.08 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3541  sulfur transfer complex subunit TusD  43.08 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.84382e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3721  sulfur transfer complex subunit TusD  42.31 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000063016  normal  0.0742653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3756  sulfur transfer complex subunit TusD  42.31 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0264721  normal  0.126397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3647  sulfur transfer complex subunit TusD  42.31 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000127633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3648  sulfur transfer complex subunit TusD  42.31 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3833  sulfur transfer complex subunit TusD  42.64 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2768  sulfur transfer complex subunit TusD  40.48 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3719  sulfur transfer complex subunit TusD  43.08 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0272  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3681  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000326504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3924  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000851286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3762  sulfur transfer complex subunit TusD  41.73 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000491404  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0313  sulfur transfer complex subunit TusD  40.31 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1925  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2452  DsrE-like protein  40.31 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000223621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2603  sulfur transfer complex subunit TusD  40.16 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0489  intracellular sulfur reduction protein DsrE  39.34 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.233677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30400  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2187  sulfur relay protein TusD/DsrE  37.01 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1331  intracellular sulfur oxidation protein DsrE  40.94 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3168  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209612  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3338  DsrE family protein  39.37 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2377  sulfur transfer complex subunit TusD  38.58 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278614  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28120  sulfur transfer complex subunit TusD  36.22 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3397  sulfur transfer complex subunit TusD  36.22 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.452785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1840  sulfur transfer complex subunit TusD  37.01 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000217326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3993  sulfur transfer complex subunit TusD  37.01 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0220527  hitchhiker  0.0053466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3598  sulfur transfer complex subunit TusD  36.22 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1953  DsrE family protein  40.46 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.370891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1655  DsrE family protein  39.39 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2483  DsrE protein  38.64 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1519  DsrE family protein  34.88 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3575  sulfur transfer complex subunit TusD  40 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3247  DsrE family protein  32.03 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253566  hitchhiker  0.0000180426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2349  putative sulfur oxidation protein DsrE  36.43 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0286329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0033  sulfur relay protein TusD/DsrE  36.75 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1853  sulfur relay protein TusD/DsrE  32.48 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.0757641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1952  DsrE protein  30.71 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0266729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2317  sulfur relay protein TusD/DsrE  33.07 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0228723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0132  DsrE family protein  33.33 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0040  DsrE protein  32.48 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.5054  normal  0.788589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0699  sulfur relay protein TusD/DsrE  31.5 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.187846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02104  sulfur relay protein TusB/DsrE  35.62 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000525154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1704  DsrE family protein  31.5 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000786463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1174  DsrE-like protein  28.42 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0013044  hitchhiker  0.000454083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0977  DsrE family protein  35.79 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000957329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1218  DsrE-like protein  28.28 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>