More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1405 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1405  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 341 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1391  oxidoreductase, zinc-binding  71.93 
 
 		 342 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01966  oxidoreductase, zinc-binding protein  65.69 
 
 		 363 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0406  alcohol dehydrogenase  58.48 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0407  NADPH:quinone reductase  58.19 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3618  NADPH:quinone reductase  58.19 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  56.89 
 
 		 349 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.094248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0658  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.48 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0074  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.72 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0666  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.48 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  57.18 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  56.89 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  57.89 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0066  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.72 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3932  alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4073  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.6 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3436  alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3880  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.31 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1160  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.48 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.43 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3020  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.09 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  54.55 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2685  putative bifunctional oxidoreductase/alginate lyase  54.55 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1753  NADPH:quinone reductase  53.08 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2953  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.97 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.67 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.603344  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2576  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.68 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2719  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3419  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.23 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0951  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.96 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1240  putative oxidoreductase  53.37 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522043  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0715  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.79 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3542  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.516815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3071  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.22 
 
 		 335 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0694028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2322  alcohol dehydrogenase  51.91 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0672997  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.79 
 
 		 341 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.08 
 
 		 338 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0125  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  52.49 
 
 		 337 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5533  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.92 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.328784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2159  hypothetical protein  52.49 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.67 
 
 		 336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0652  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.61 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.215695 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2133  hypothetical protein  52.2 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0088  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.32 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.211102  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5645  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.34 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5040  putative oxidoreductase  51.17 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3639  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.79 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1096  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.46 
 
 		 337 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.381696  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1565  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.55 
 
 		 339 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2006  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.37 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.51 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.71 
 
 		 338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1687  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.79 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3175  NADPH:quinone reductase zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.71 
 
 		 339 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0158861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4026  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.26 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622195  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0947  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.15 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1789  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.12 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3470  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.12 
 
 		 339 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3233  zinc-binding dehydrogenase; alginate lyase  48.83 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000117644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.12 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.144569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5176  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.22 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.42 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3489  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.83 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  49.12 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.83 
 
 		 339 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3928  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.15 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0933  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.95 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5281  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.29 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1033  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  49.42 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3759  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0984  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5075  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1861  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.46 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  normal  0.0964834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4370  alcohol dehydrogenase  50.88 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1776  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363209  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6303  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2325  alginate lyase  50.29 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502428  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3309  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1801  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.83 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.590964  normal  0.594386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0429  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 335 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4454  alcohol dehydrogenase  48.13 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0799  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.04 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115573  normal  0.158773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0521  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.82 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02525  oxidoreductase  47.45 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0669  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0751  quinone oxidoreductase  42.18 
 
 		 328 aa  268  8e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.199766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3875  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.51 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3681  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.12 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1189  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0550  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2637  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6077  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.65 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2780  Alcohol dehydrogenase. zinc-binding type 1  43.95 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207302  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1553  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.88 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1785  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.3 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2217  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  52.66 
 
 		 774 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>