More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0091 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0091  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
100 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  93.83 
 
 
448 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  79.01 
 
 
447 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
445 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  76.25 
 
 
446 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  77.22 
 
 
456 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  75.95 
 
 
452 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  75.31 
 
 
450 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  75.31 
 
 
450 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  72.84 
 
 
445 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  72.84 
 
 
466 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  75 
 
 
446 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
448 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
450 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 
450 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
448 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  76.25 
 
 
448 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 
450 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  70.37 
 
 
465 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  73.75 
 
 
446 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  73.75 
 
 
446 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  72.84 
 
 
450 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  72.84 
 
 
449 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  73.75 
 
 
446 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  70.37 
 
 
451 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 
450 aa  121  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  73.75 
 
 
444 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  74.07 
 
 
449 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3025  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  73.75 
 
 
239 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  70.37 
 
 
459 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  73.17 
 
 
447 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 
451 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  69.14 
 
 
451 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  71.95 
 
 
447 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
451 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  71.6 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  67.9 
 
 
450 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  65 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  65 
 
 
454 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
449 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  69.51 
 
 
447 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  65.43 
 
 
450 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  70.73 
 
 
447 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  62.96 
 
 
450 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  64.2 
 
 
469 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
450 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  64.2 
 
 
458 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 
451 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 
451 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  70.73 
 
 
447 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  70.73 
 
 
447 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  61.73 
 
 
449 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  65.82 
 
 
452 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 
454 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  62.96 
 
 
450 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  62.96 
 
 
450 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  65.82 
 
 
483 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  65.79 
 
 
496 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  62.65 
 
 
460 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  65.79 
 
 
496 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  62.96 
 
 
452 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  61.73 
 
 
444 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  61.73 
 
 
444 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
444 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  61.73 
 
 
443 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
453 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  60.47 
 
 
447 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  58.02 
 
 
443 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  58.02 
 
 
445 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  60.47 
 
 
447 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
443 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  60.47 
 
 
447 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
447 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  58.23 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  58.62 
 
 
452 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  59.49 
 
 
445 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  60.76 
 
 
445 aa  97.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  57.47 
 
 
452 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  58.02 
 
 
459 aa  95.9  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  56.96 
 
 
445 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  58.82 
 
 
447 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
444 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  56.96 
 
 
445 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 
443 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 
460 aa  94.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 
445 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 
443 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 
446 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  56.79 
 
 
446 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  61.25 
 
 
454 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  57.32 
 
 
454 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  57.32 
 
 
454 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>