198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0088 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0088    100 
 
 
276 bp  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.380972  normal  0.996157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  100 
 
 
698 bp  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1815    99.64 
 
 
1749 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2713    99.64 
 
 
3054 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  99.64 
 
 
698 bp  539  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    99.28 
 
 
698 bp  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  99.28 
 
 
698 bp  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  99.28 
 
 
698 bp  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00023  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00210  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00236  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00314  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00341  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    98.55 
 
 
1860 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00505  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.429468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00546  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00572  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0146292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00588  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    98.55 
 
 
1689 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01116  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    98.55 
 
 
2672 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01243  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01372  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01880  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01935  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02041  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02144  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02271  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    98.55 
 
 
2195 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02451  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04180  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    98.55 
 
 
1425 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02647  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02824  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000223419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    98.55 
 
 
1863 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03228  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    98.55 
 
 
1673 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03485  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00318  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04164  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04181  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04208  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    98.55 
 
 
2201 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01123  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04288  IS1 protein InsA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    98.55 
 
 
698 bp  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    98.55 
 
 
698 bp  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    98.55 
 
 
698 bp  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00535  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    98.55 
 
 
698 bp  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00345  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02103  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01252  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0367  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.353795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0738  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000115331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0781  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1141  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00733334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1164  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1385  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1529  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1652  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000502685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1780  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1899  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01384  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00577  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2417  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0743259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2649  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2654  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000881357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2760  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000206512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2786  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2921  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3006  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3092  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3144  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3239  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0478113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3687  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4685  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01981  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01999  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.967964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00510  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.490778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4912  IS1, transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01870  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00561  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0168725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01922  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3119  IS1 transposase orfA  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00239  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00024  hypothetical protein  98.55 
 
 
276 bp  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>