193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0028 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0028    100 
 
 
138 bp  274  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  0.282474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2197  IS1, transposase orfA  98.98 
 
 
276 bp  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.101655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2254  IS1 transposase orfA  96.94 
 
 
213 bp  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.697186  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0049  IS1, transposase orfA  96.94 
 
 
276 bp  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.561521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0534    95.96 
 
 
2436 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1999  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.69101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1546  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
180 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3449  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
276 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0705  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338956  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0010  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
213 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4801  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3050  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2061    95.96 
 
 
2388 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.400756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0547  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3481  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0752562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3915    95.96 
 
 
2178 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3445  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04160  IS1 protein InsA  95.96 
 
 
276 bp  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0533  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2000    95.96 
 
 
1617 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2395  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1977  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.597329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0928  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3269  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4284  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4206  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3788  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4072    95.96 
 
 
213 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4539  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4740  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.610496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04123  hypothetical protein  95.96 
 
 
276 bp  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4895  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2177  IS1, transposase orfA  95.96 
 
 
276 bp  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4869  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.607865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0467  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1064  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000575561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1728  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.793501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1672  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0996  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000873368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0131  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2059  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.737234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1892  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0015  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3071  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4871  IS1, transposase orfA  95.96 
 
 
276 bp  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0746    95.96 
 
 
698 bp  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3510  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3253  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4648  IS1 transposase orfA  95.96 
 
 
192 bp  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4758  IS1 transposase orfA  95.92 
 
 
213 bp  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.267122  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4824    94.95 
 
 
1974 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3363  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3943  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1662    94.95 
 
 
2712 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3706    94.95 
 
 
698 bp  157  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0605  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2357  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000108555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4940  IS1, transposase orfA  94.95 
 
 
276 bp  157  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1734  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  94.95 
 
 
698 bp  157  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  94.95 
 
 
698 bp  157  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4584  IS1 transposase orfA  94.95 
 
 
192 bp  157  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.42041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1709  IS1 transposase orfA  94.9 
 
 
192 bp  155  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02513  IS1 protein InsA  94.9 
 
 
276 bp  155  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02477  hypothetical protein  94.9 
 
 
276 bp  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1815    94.9 
 
 
1749 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2713    94.9 
 
 
3054 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  94.9 
 
 
698 bp  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  95.6 
 
 
698 bp  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00341  IS1 protein InsA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    93.88 
 
 
1860 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01116  IS1 protein InsA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    93.88 
 
 
2672 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02451  IS1 protein InsA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    93.88 
 
 
1425 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02824  IS1 protein InsA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000223419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    93.88 
 
 
1863 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03228  IS1 protein InsA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04180  hypothetical protein  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0781  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1141  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00733334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1529  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1652  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000502685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1780  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1899  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2417  IS1, transposase orfA  93.88 
 
 
276 bp  147  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0743259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>