19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2658 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2658  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.550695  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2567  hypothetical protein  98.81 
 
 
253 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00554266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2682  hypothetical protein  98.81 
 
 
253 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2616  hypothetical protein  98.81 
 
 
253 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2788  hypothetical protein  98.42 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2562  hypothetical protein  83.33 
 
 
254 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0152176  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1254  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  84.94 
 
 
254 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3059  hypothetical protein  60.94 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000874464  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3097  hypothetical protein  60.55 
 
 
255 aa  287  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.152183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0972  hypothetical protein  41.39 
 
 
269 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000604021  decreased coverage  0.000188692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0014  hypothetical protein  32.44 
 
 
253 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1505  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0037  hypothetical protein  33.72 
 
 
254 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0038  putative outer membrane/exported protein  33.21 
 
 
253 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.457943  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0038  hypothetical protein  32.84 
 
 
253 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0039  putative outer membrane/exported protein  32.84 
 
 
253 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0037  putative outer membrane/hypothetical protein  32.84 
 
 
253 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548328  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0236  hypothetical protein  23.33 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4026  hypothetical protein  26.2 
 
 
248 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>